La segunda pestaña contiene un formulario con las opciones que ofrece MOSS para afinar el algoritmo de detección de plagio. Son las siguientes:

• Language (-l) Informa sobre el lenguaje fuente en el que está escrito el código.
• Base file (-b) En caso de que haya un fichero común a todos los programas a comparar puede enviarse para facilitar la tarea de MOSS
• Maximum number of times a given passage may appear before it is ignored (-m): Es el número de repeticiones de un mismo trozo de código en distintos programas a partir del cual MOSS considera que ese trozo de código es parte del enunciado que se proporciona a los alumnos y por tanto no lo tiene en cuenta al calcular los pordentajes de similitud.
• Number of matching files to show in the results (-n): Número máximo de ficheros que se muestran en la comparación. Esto facilita la tarea de MOSS y elimina del listado final de comparaciones aquellas con un menor grado de similitud.
• Use experimental version of the server (-x): Si se usa la versiónclásica o la nueva (en experimentación).